Рассада перца может замереть в росте из-за кислой почвы, переувлажнения, нехватки света или сквозняков. Также, корни могут задыхаться из-за уплотненной или слишком рыхлой почвы, а также из-за переувлажнения и холодной почвы. Чтобы исправить положение, нужно повысить температуру почвы, наладить подсветку и регулировать поливы. Сеянцы не нужно удобрять до начала роста, но можно провести опрыскивание Энергеном.